NBDC是日本科學技術振興機構（JST）的生命科學研究資料整合與服務計畫，目前設於JST資訊服務部門的NBDC計畫辦公室。官方介紹指出，計畫負責研究資料的蒐集、整理與公開，推動各領域核心資料庫的建置和整合，並提供便於搜尋、瀏覽及利用資料的資訊基礎設施。直接提供的網路服務包括Integbio資料庫目錄（彙整日本國內外生命科學資料庫資訊）、生命科學資料庫跨庫搜尋，以及長期保存並公開研究人員寄存資料集的生命科學資料庫典藏庫。典藏庫支援整批下載，也能在瀏覽器中簡易瀏覽和搜尋，並為資料集提供統一格式的中繼資料、個別使用條件與DOI。NBDC希望讓生命科學研究資料更加豐富、互連且易於使用，進而促進新知識與創新；JST也說明計畫會與日本及海外機構合作推動相關工作。
J-GLOBAL是日本科學技術振興機構（JST）提供的科學技術資訊資料庫。JST將它介紹為連結多個科學技術資料庫的綜合入口，並說明服務旨在透過連結與擴展資訊，協助產生新構想。依據官方介紹，平台提供九個領域的基礎資訊與彙整資訊，包括研究人員、研究論文、專利、研究計畫、機構、科技術語、化學物質、材料及研究資源。其資訊範圍涵蓋研究人員與研究成果，也包括組織、專業術語、物質和資源，並不限於論文或專利。J-GLOBAL的核心定位，是將科學技術領域中這些不同類型的資訊納入彼此連結的資料庫服務。 這九類資訊共同構成JST所列資料庫服務的主要內容範圍。
CiNii Research是日本國立情報學研究所（NII）提供的學術資訊探索服務。除了論文，使用者也能搜尋研究資料、圖書、博士論文、研究計畫及研究人員資訊。首頁可選擇資料類型，並跨資料庫檢索機構典藏庫、KAKEN科研補助計畫與成果、國立國會圖書館期刊文章索引、JaLC、Crossref、OpenAIRE等來源的紀錄。搜尋結果提供書目資訊和研究資料說明；若全文由其他機構公開，使用者可循連結前往提供單位的頁面，圖書則能查找館藏資訊。CiNii Research並不直接保存及提供所有搜尋結果的全文，文章能否閱讀、顯示權限與再利用條件取決於來源資料庫及個別資料。研究人員與學生可一起探索文獻、資料和研究計畫，其他讀者也能藉此發現日本學術資源。它是連接多個學術資料庫的搜尋入口，而非單一的全文典藏庫。
J-STAGE是由日本科學技術振興機構（JST）開發與營運的學術出版平台，目標是傳播日本研究成果並推動開放取用。平台收錄日本學術團體及研究機構出版的期刊、研討會論文集、研究與技術報告、雜誌及其他出版品。讀者可搜尋論文，也能依刊名、出版機構或學科領域瀏覽；涵蓋科學、技術、農業、醫學、人文、社會科學與跨領域研究。官方介紹列出日本2,400多家出版機構所提供的4,000多種出版品，並表示超過90%的論文可免費閱讀。開放取用文章會顯示創用CC授權及其再利用條件。搜尋和閱讀不需建立帳戶；使用者可選擇免費註冊My J-STAGE，以保存常用搜尋條件並接收新論文通知。每篇文章的存取與再利用權利可能不同，應依個別文章顯示的授權和存取資訊判斷，不應假設平台上的所有內容都能不受限制地使用。
AgriKnowledge是用來查找日本農業、林業與漁業研究論文及相關資訊的文獻服務，可跨多個資料庫整合搜尋，也能分別查詢個別資料庫。JASI（日本農學文獻索引）收錄日本每年出版的約500種農林水產學術期刊中論文等資料的書目資訊。AGROLib（農林水產文獻圖書館）提供研究機構、公立試驗研究機構、大學及學會、協會等出版品中已取得刊載許可的全文資料。另設有歷史農具資料庫，可按名稱或用途搜尋日本農村過去使用的農具與民俗器物，並檢視相關圖片；該資料庫明確標示為典藏檔案，未規劃新增資料。研究人員和學生可用來查找文獻，農業生產或政策工作者也能搜尋相關參考資料。全文只包含取得刊載許可的內容，展示農具或使用圖片可能另須申請授權。各筆資料的公開及再利用條件不盡相同，不宜將整個資料庫視為所有內容皆可自由下載或使用。
日本農研機構（NARO）是以促進日本農業與食品產業發展為目標的國家研究機構，從事涵蓋基礎研究到應用開發的多元研究。其遍布全國的研究據點與專業研究中心，研究作物、食品、農業機械、農業環境及動物衛生等領域。機構網站依主題介紹研究計畫、成果與新聞，並分別提供農業生產者、企業、研究人員與學生及一般民眾所需的資訊。為協助研究成果在生產現場與產業中落實，網站亦提供標準作業程序（SOP）、品種與專利資料，以及共同研究和技術移轉資訊。官方研究成果之一介紹了適用於包括水稻在內13種作物的土壤診斷AI，利用土壤分析與農務資料判斷土壤狀況並提出改善建議。NARO表示，該系統對13種作物的建議與專家意見一致率皆達90%以上，也說明可加入地區或生產法人資料來調整模型。這項AI是以研究成果形式介紹，頁面並未表示它已成為普遍提供給大眾使用的產品或工具。
日本環境省環境地理入口是用來搜尋與取得環境地理空間資料的開放資料目錄。使用者可搜尋資料集、在地圖上預覽其空間範圍，下載多種地理資訊格式的檔案，也可透過Web服務或API使用資料。目錄依水、空氣與土壤環境，以及自然環境與生物多樣性等主題整理。入口網站展示的資料包括珊瑚淺海生態系現況調查、日本梅花鹿全國分布網格、植生調查資料與相關文件。首頁會發布新資料和更新資訊，若部分資料集的下載網址變更也會公告。從事環境調查、自然保育、區域規劃或空間分析的使用者，可先依關鍵字或主題找到資料，再透過地圖確認位置，並按照個別資料集提供的方式下載或連接API。這是日本環境省營運、專門整理環境空間資訊的目錄，不是一般新聞或天氣網站。各資料集的授權與費用可能不同，使用前宜查看個別項目的說明與條件。
環境展望台是由日本國立環境研究所（NIES）營運的環境資訊入口，集中呈現日本各地的環境地圖、觀測資料、預測、統計與研究成果。環境GIS可用來查看全國及地方的大氣污染、水質等狀況，並提供光化學氧化劑與PM2.5濃度預測、黃沙觀測和預報、熱指數、交通噪音、酸雨、戴奧辛及海洋環境監測圖層。其他地圖與圖表還包括市町村別家庭二氧化碳排放估算、土地利用、人口分布情境、一般廢棄物統計及中暑急救送醫人數。獨立的常時大氣污染監測資料頁面可依都道府縣、監測年度和污染物篩選，下載月值、年值、逐時值與測站資料。NIES說明，只要在公開成果中標示來源，下載資料即可自由使用；頁面也提供資料涵蓋情況與更正公告。民眾、地方政府、研究人員、教育機構和企業可藉此了解並比較日本不同區域的環境狀況。
日本氣象業務支援中心是連結日本氣象廳、民間氣象企業、新聞媒體及其他氣象資訊使用者的公益財團法人，負責迅速且可靠地傳送氣象廳發布的資訊。其線上服務提供電文格式與檔案格式的氣象資料、氣象衛星影像、緊急地震速報、防災氣象資訊及氣象廳雲端環境等內容。線上資料配送須支付資訊提供費用，申請者可向中心索取申請及接收資料所需文件。離線資料業務則提供氣象廳持有的統計、衛星、客觀分析、地震震源與波形、高空氣象及海上資料，目錄列出各項資料的收錄期間與銷售價格。網站也說明CSV等格式的編輯氣象資料、訂購方式和資料傳輸技術文件。除此之外，中心還辦理氣象預報士考試、氣象儀器檢定、專業講習會及氣象研究支援，協助日本官方氣象資訊的流通與應用。
日本氣象廳的「歷史氣象資料查詢」讓使用者選擇日本各地的觀測站與日期，查看該地的歷史觀測紀錄及氣候平均值。頁面提供年、月、日統計，以及逐日、逐小時和每十分鐘觀測值、觀測開始以來的月值、三個月統計，並可選擇不同時間尺度的氣候平均值。使用者還能查閱各站歷史前十名紀錄、全國歷年排名及網格化氣候平均值地圖，並從相關連結前往區域平均資料或高空觀測資料。氣象廳另提供依條件設定並下載部分氣象資料的入口，例如每週彙整值。頁面說明氣候平均值以1991至2020年三十年的觀測平均計算，也提醒已公布資料有時會追溯修訂。民眾、學生、研究人員與企業可依地點、期間及資料種類查詢日本的氣象觀測歷史；引用或再利用前宜確認最新公布內容。
日本氣象廳「您所在區域的防災資訊」入口，可依都道府縣或市町村查看當地天氣與災害資訊。頁面彙整豪雨、洪水等警報與注意報、雨雲移動及降雨預測、氣象雷達、向日葵衛星影像、AMeDAS地面觀測、降水機率、風與沿岸海浪預報、每週天氣預報、天氣圖及地震資訊。使用者也可透過Kikikuru等地圖資料查看所選區域的防災狀況。氣象廳說明頁指出，選定地區後，日後再次瀏覽時也能顯示該地區。降雨資料包含短時間雨雲動態與較長時段的降雨預測；地震資訊則列出發生位置、深度、各地震度及近期發布內容。這是日本官方氣象與災害資訊的公共入口，方便民眾與組織按地點查找所需資料，並非商業天氣應用程式。
日本資料管理聯盟（JDMC）是日本的一般社團法人，宗旨是推廣資料管理的重要性、建立可實際運用的方法，並協助提升日本企業與組織的國際競爭力。官方組織簡介指出，聯盟於2011年成立，並倡議超越企業資訊系統範圍的開放式活動。網站發布資料運用與資料治理案例、研究小組及研討會資訊、活動報告、公開資料、出版品與會員資訊，讓企業、組織及專業人士了解實務經驗並交流資料管理知識。2026年的內容涵蓋AI代理的資料庫設計、生成式AI所需的企業資料整備，以及資料治理等主題。一般文章與組織資訊可公開瀏覽，網站另設會員專用區。已檢視的官方頁面未列出會費金額。
日經NEEDS是日本經濟新聞社提供的經濟資料服務，面向企業、市場與景氣分析。官方網站說明，其使用者包括金融專業人士、各類企業及學術機構。資料目錄涵蓋企業與財務、股票與債券、商品、國內外總體經濟與金融、區域經濟及產業領域，可查詢企業財務與屬性資訊、主要股東、證券資訊、商品價格、物價、就業、貿易等經濟統計，以及區域與產業統計。FinancialQUEST可線上取得NEEDS資料；BULK服務則依約定時程將最新資料定期傳送至客戶系統。網站亦列出配合不同用途的其他資料產品與服務方式。日經表示其資料庫服務為付費服務，使用原則上須簽訂法人合約，因此並非供一般大眾免費下載資料的入口網站。資料範圍、交付方式與合約條件，應以各項服務頁面的說明為準。
日本地理院地圖是日本國土地理院提供的官方互動地圖，可疊加檢視該機關製作的地形圖、航空照片、高程、地形分類及災害資訊圖層。使用者可搜尋地名或地址定位，切換不同底圖與主題圖層，也能將不同年代的航空照片並排或疊合比較。地圖工具可繪製標記、測量距離、查看地址與高程、產生兩點間的地形剖面、依高度為地形著色，並以3D方式瀏覽地形和照片。此服務適合地理教育、地方調查及防災減災工作，協助理解土地特徵與可能風險。地理院圖磚和個別圖層各有使用條件及出處標示要求；若要再利用或重新發布地圖資料，請先查閱官方圖磚清單與使用條款。可直接透過瀏覽器使用地圖。
日本國土數值資訊下載網站是國土交通省營運的官方入口網站，免費公開供國土政策與地方分析使用的基礎地理空間資料。使用者可依主題搜尋全國範圍的地形與高程、土地利用、地價、行政區域、都市計畫、洪水及其他災害風險、公共設施、道路、鐵路、交通與人口統計等資訊。資料以GIS用途為主，提供符合JPGIS規範的資料、Shapefile、XML及GeoJSON等格式；部分內容也可在網站地圖系統中檢視。網站另有QGIS、Tableau操作手冊與資料應用案例。下載免費，但各資料集的授權範圍、商業使用權及限制不同。官方也提醒部分資料可能比現況落後數年，甚至約五年，空間精度亦不適用於導航或辨識單棟建築。使用前應確認個別資料的製作日期、精度、來源與授權條件。
日本地理空間資訊中心是一個資料流通平台，協助使用者搜尋、取得並運用由政府機關、地方自治體、研究機構及企業等不同單位建立的地理空間資訊。平台由社會基礎設施資訊流通推進協議會（AIGID）營運，提供資料集目錄、使用指南、應用案例，以及供資料提供者參考的登錄說明。目錄涵蓋Project PLATEAU三維城市模型、點雲、人流、防災、都市計畫、基礎設施與不動產等主題。各資料集的公開範圍與下載條件不盡相同；部分已公開資料仍須登入才能下載，也有付費內容。因此不應假設目錄內所有資料都能免費取得，使用前需查看個別資料集說明與條款。此平台適合尋找GIS分析、研究、行政作業及地方問題解決所需的空間資料。
e-Gov資料入口網站是日本數位廳建置與營運的中央政府開放資料目錄，收錄行政機關等持有並以開放資料形式提供的公共資料。使用者可從多種角度跨目錄搜尋資料集，查看各資料集登錄的檔案、網址與內容，了解可利用的資訊。網站支援依人口與家庭、運輸與觀光、社會保障、教育、商業等類別瀏覽，也可按提供機關查找，並設有將相關資料集整理展示的專題案例集。入口網站另有資料集交流功能，可閱讀其他使用者對資料的評價、意見與需求、活用案例及問題回報；登入後可自行投稿。其定位是協助使用者發現、理解並再利用日本政府的開放資料，而不是由入口網站製作所有底層資料。
jSTAT MAP（在地圖上查看統計）是日本政府統計入口e-Stat提供的網路地理資訊系統，可將都道府縣、市町村、小區域及地域網格層級的統計結果顯示於地圖，協助使用者觀察區域差異。官方說明指出，使用者可運用政府統計或自行提供的資料製作統計地圖與圖表、設定分析區域，並將簡易報告輸出為HTML或Excel。網站將這些功能定位為防災、設施規劃及市場分析等區域計畫的基礎分析工具。無須登入即可建立地圖、圖表、區域及簡易報告；但儲存資料、地理編碼、匯入或匯出資料，以及製作豐富報告等功能需要使用e-Stat帳戶登入。它可將官方統計轉化為可視化的區域分析內容。
RESAS（區域經濟分析系統）是日本政府提供的網路系統，透過地圖與圖表呈現區域經濟相關大數據，協助使用者分析各地情況。官方網站設有行銷、觀光、人口、產業結構、區域經濟循環、農林漁業以及醫療與長期照護等分析選單。使用者可以查看觀光景點周邊特色、消費銷售趨勢、通行人口網格、事業所分布、經營環境及人口組成變化等主題地圖與分析畫面，作為了解地方現況、研議政策或構思事業的資料依據。官網明確表示系統免費使用且不需註冊ID。頁尾列出日本內閣府地方創生推進室及經濟產業省中小企業廳相關團隊。 網站並集中呈現現有功能選單與各項分析示例，方便地方政府、研究人員及企業從同一入口瀏覽不同類型的區域指標；這些內容是視覺化分析工具的介紹，並非單一商業資料庫或自動產生結論的服務。
