Merpay é um serviço de pagamento móvel integrado ao aplicativo Mercari, reunindo pagamentos, gestão de uso e liquidação. O saldo das vendas feitas no Mercari e os pontos podem ser usados em lojas físicas e compras on-line. O site oficial informa suporte a iD e pagamentos por código em estabelecimentos japoneses, como lojas de conveniência, restaurantes e farmácias. O cartão Merpay relacionado permite usar saldo e pontos em compras com cartão. O site oferece guias, perguntas frequentes, artigos, notícias, pagamento on-line para comerciantes, dados da empresa e informações legais.